مجلس شورای اسلامی به پنجمین وزیر پیشنهادی حسن روحانی، رئیس جمهوری ایران برای وزارت علوم،تحقیقات و فناوری رای اعتماد داد. در جلسه روز چهارشنبه مجلس، از ۲۳۵ رای اخذ شده، ۱۹۷ نماینده به محمد فرهادی رای اعتماد دادند و ۲۷ نفر رای مخالف دادند. ۱۰ نفر نیز رای ممتنع دادند.
حسن روحانی روز چهارشنبه در جلسه بررسی صلاحیت محمد فرهادی گفت: «آخرین انتخاباتی که به هر حال ما افکار مردم را دیدیم و باید معیار ما باشد ۲۴ خرداد است.»
رئیس جمهوری ایران گفت: «وزیری که امروز خدمت شما معرفی شده، دارای سوابق گسترده و درخشان از آغاز انقلاب اسلامی است.»
روحانی که از چهار گزینه قبلی اش برای این وزارتخانه سه نفر رای عدم اعتماد گرفتند و یک نفر نیز استیضاح و برکنار شد، گفت: «اگر دموکراسی ما حزبی بود ما دو تا سه حزب بزرگ داشتیم، اقلیت داشتیم، اکثریت داشتیم، دولت و مجلس معمولا از یک حزب بود حتی اگر از دو حزب بود معلوم بود و کمی کار در تعامل سیاسی آسانتر بود.»
آقای روحانی گفت: «قانون اساسی ما این شیوه را برگزیده و انتخاب کرده و ما هم در طول این مدت همین راه را ادامه دادیم. البته امتیازاتی را هم این شیوه دارد و مشکلات خودش را دارد اما این به این معنا نیست ما برای آینده فکر نکنیم و راه بهتر پیدا نکنیم. اما به هر حال شیوه دموکراسی ما این چنین است.»
محمد فرهادی روز چهارشنبه در سخنان خود گفت: «برای ارتقا همه علوم از انسانی تا مهندسی به میدان مسئولیت آمده ام.» او گفت: « باید رشته هایی که برای کشور سودی ندارند را کنار بگذاریم و رشته های مورد نیاز را جایگزین آنها کنیم.»
به گزارش مهر، فرهادی گفت: «دانشگاه ها باید محل تضارب آرا باشد.» اما اضافه کرد: «باید جلوی نشریات و انتشاراتی که در مسیر انقلاب و اجتماع حرکت نمی کنند گرفته شود.»
فرهادی گفت در جریان اعتراضات ۱۳۸۸ هیچ نامه ای را امضا نکرده و از مدیرانی استفاده خواهد کرد که «علاوه بر باور به ارزش های انقلاب از توانایی لازم بهره مند باشند.»
در جلسه روز چهارشنبه، علی مطهری، نماینده مجلس شورای اسلامی به عنوان نماینده مخالف صحبت کرد و مجلس شورای اسلامی را به داشتن «منطق دوگانه و یک بام و دو هوا» متهم و گفت: «این شائبه پیش می‌آید که خدای نکرده معامله‌ای در کار است.»
علی مطهری گفت «علت مخالفت من با وزیر پیشنهادی علوم، موافقت فضای عمومی مجلس با وی است، در حالی که دو وزیر پیشنهادی قبلی قوی‌تر بودند و با معیار فعالیت در فتنه، از سوی مجلس رد شدند.»
به گزارش خبرگزاری ها، علی مطهری گفت: «نیلی احمدآبادی را به جرم امضای تظلم ۸۸ و به دلیل قضیه حمله عده‌ای به دانشکده فنی دانشگاه تهران، ضرب و شتم و بازداشت دانشجویان فتنه‌گر نامیدیم و به او رأی اعتماد ندادیم، آقای دانش آشتیانی را هم به جرم امضای یک نامه انتقادی در جریان حوادث سال ۸۸ فتنه‌گر نامیدیم و هر چه گفت اطلاعی از آن نامه ندارم و نام من را بی‌خبر جزو امضاکنندگان قرار داده‌اند از او نپذیرفتیم و گفتیم الان دیر است، باید همان موقع تکذیب می‌کردید، همچنین آقای دانش آشتیانی را که به جرم همکاری با حزب مشارکت ضد نظام دانستیم و گفتیم صلاحیت وزارت را ندارد.»
علی مطهری گفت: «اکنون آقای فرهادی به عنوان وزیر پیشنهادی علوم به مجلس معرفی شده است در حالی که وی در کارنامه سیاسی خود امضای نامه‌ای را به همراه آقایان خاتمی، موسوی و کروبی و ده‌ها استاد دانشگاه‌ها و افراد سیاسی دیگر خطاب به مراجع تقلید در اعتراض به نحوه برخورد مأموران امنیتی و نظامی با مردم معترض دارد.»
فرهادی گفت: «هیچ نامه‌ای را امضاء نکرده‌ام حال اگر اسم هست یا نیست نمی‌دانم. بنده معتقدم فصل‌الخطاب رهبری هستند و فتنه خط قرمز ماست.»
علی مطهری گفت نامه فرهادی در سایت ها منتشر شده و بخشی از آن را نیز قرائت کرد.
اما علی لاریجانی، رئیس مجلس شورای اسلامی با رد اظهارات علی مطهری گفت: «اتهام زنی به مجلس در عدم رأی دادن به وزرا اقدام ناجوانمردانه‌ای است.»