در ادامه موج مخالفتها با اخراج اساتید منتقد نظام، و حمایت وزارت کشور از این اخراج‌ها محسن برهانی استاد حقوق دانشگاه تهران در شبکه اجتماعی «اکس» نوشت: «وقتی یک نظامی وزیر کشور می‌شود، دانشگاه و مملکت با قواعد پادگانی اداره خواهد شد.»
او افزود: «حالا مشخص شد، که احتمالا دستورات غیرقانونی شورای امنیت کشور منشأ برخی اخراج‌هاست.»
علی مجتهدزاده، حقوقدان هم در واکنش به بیانیه وزارت کشور درباره اخراج استادان نوشت: «حمایت وزارت کشور از اخراج اساتید، دخالت آشکار و فراقانونی در حیطه وظایف و مسئولیت‌های تخصصی وزارت علوم است.»
او همچنین تصریح کرد: «وزارت کشور نه اختیار قانونی برای اعتبارسنجی علمی اساتید را دارد و نه صلاحیت فنی لازم را و این اقدام شائبه سیاسی بودن اخراج‌ها و فشار‌های خارج از دانشگاه را تقویت می‌کند.»
مرکز اطلاع‌رسانی وزارت کشور روز دوشنبه ۶ شهریور، اعتراض‌ها و انتقادها به اخراج اساتید را «جوسازی‌های رسانه‌ای» توصیف کرد و اعلام کرد: «آن چه وزارت علوم در برابر معدود اساتیدی که دچار رکود علمی بوده، اما نقش مهمی در نمایش‌های رسانه‌ای داشته‌اند، صورت داده کاملاً بر مبنای موازین قانونی و اداری و البته وظیفهٔ انقلابی این وزارت‌خانه برای پویایی علمی و فرهنگی دانشگاه‌ها بوده است که جای تقدیر دارد.»
در همین زمینه فرشید نوروزی، عضو پیشین هیئت علمی دانشگاه مازندران به صدای آمریکا گفت:«بسیاری از مقامات دانشگاههای ایران، وابسته به نهادهای امنیتی و نظامی هستند و پیشتر هم همین بوده اما حالا این پدیده علنی شده است.»
او نهاد دانشگاه به ویژه رشته‌های علوم انسانی را در ایران «مرده» دانست و افزود: «حاکمیت سعی کرده راسا به این بخش ورود پیدا کند که در نتیجه موجی از ناامیدی و یاس را در میان اقشار دانشگاهی ایجاد کرده است.»
میلاد پورعیسی، خبرنگار حوزه دانشجویی نیز درباره نفوذ نیروهای حکومتی و اخراج اساتید منتقد و مخالف، به صدای آمریکا گفت: «سالهاست که شاهد یک تشکل‌زدایی بسیار شدید در دانشگاههای ایران هستیم که این روند در چند ماه گذشته شدت بیشتری گرفته است.»
او اضافه کرد: «برخی اسناد امنیتی منتشر شده در ماههای گذشته نشان می‌دهد که حاکمیت از تاثیر دانشگاهیان به اعتراضات واهمه زیادی دارد و دانشگاه را برای خود یک بحران می‌پندارد و تلاش می‌کند از حرکتهای غیرقابل پیش‌بینی دانشجویان به هر نحو ممکن جلوگیری کند.»
