نزدیک به شش ماه پس از تصویب طرح «تحقیق و تفحص» از سازمان «اوقاف» در مجلس، اجرای آن همچنان در هاله‌ای از ابهام قرار دارد، چون این سازمان زیر نظر نماینده علی خامنه‌ای اداره می‌شود و برای تحقیق در مورد آن باید رهبر جمهوری اسلامی اجازه را صادر کند.
روزنامه «اعتماد» در گزارشی به موضوع تصویب «تحقیق و تفحص» از سازمان اوقاف پرداخته و نوشت که مشخص نیست نمایندگان چرا در هنگام بررسی طرح در جلسه علنی که حدود ۶ ماه پیش انجام شد، «لزوم اخذ اذن از مقام رهبری» را متذکر نشدند و این طرح را بدون طی «تشریفات قانونی و تامین مقدمات» در صحن مطرح کردند.
این روزنامه با تاکید بر لزوم صدور اجازه از علی خامنه‌ای برای ورود به موضوع «اوقاف» به نامه رئیس سازمان اوقاف در این مورد اشاره کرد و نوشت که رئیس این سازمان در نامه‌ای تاکید کرده که نمایندگان مجلس می‌توانند «در چارچوب ضوابط مربوطه» درباره «اعتبارات دولتی» این سازمان سوال کنند.
برهمین اساس طبق اعلام مهدی خاموشی در موضوعات «مربوط به موقوفات»، «مراتب متوقف به ارایه اذن از ناحیه مقام معظم رهبری» است. بنابراین نامه خاموشی رسما اعلام کرده است که بدون اجازه علی خامنه‌ای به هیچ سوالی پاسخ نخواهد داد.
محمدباقر قالیباف در جایگاه رئیس مجلس نیز در پاسخ به انتقادات گفته است: «امورات وقف نیازمند مجوز بوده و در این زمینه نیز یک جلسه هماهنگی برگزار شده است و در حال دنبال کردن موضوع هستیم.»
درپی حاشیه‌های ایجاد شده در مورد عملکرد سازمان «اوقاف و امور خیریه کشور» و رونمایی از رانت‌های کلان در این بخش؛ نمایندگان مجلس ۲۷ تیر ماه با تقاضای تحقیق و تفحص از عملکرد سازمان اوقاف موافقت کردند.
یکی از موارد مورد اشاره در محورهای تحقیق و تفحص، تهیه گزارش مبسوط از «رقبه‌ها و موقوفاتی» است که سال‌ها به «ثمن بخس» در اختیار افراد ذی نفوذ و غیر مرتبط قرار گرفته است.
یکی دیگر از محورهای تحقیق و تفحص گزارش شیوه قیمت گذاری موقوفات جهت واگذاری به اشخاص اعم از مشارکت، اخذ پذیره یا اجاره و یا سایر روش‌ها است.
این اقدام مجلس پس از آن صورت گرفت که وحید اشتری، افشا کننده «سیسمونی گیت» مربوط به خانواده رئیس مجلس شورای اسلامی اعلام کرد که موقوفه ۱۵۰ هکتاری در قزوین به همراه یک دامداری هزار راسی در قبال ماهی یک میلیون تومان اجاره به عروس رئیس سازمان اوقاف واگذار شده است.
در ماه‌های نخستین سال جاری بخش‌هایی از چندین پرونده مربوط به موقوفه‌های بزرگ در ایران منتشر شد که بر اساس آنها، مقامات ارشد حکومتی یا بستگان نزدیکشان از جمله صاحبان اصلی انتفاع و درآمدهای حاصله از این املاک، نجومی بوده‌اند.
یکی از این افراد احمد علم‌الهدی، امام جمعه مشهد و پدر همسر ابراهیم رئیسی است که پس از افشاگری صورت گرفته مبنی بر واریز حق تولیت اوقاف در خراسان، از این اقدام خود دفاع کرده بود.
