عالی‌ترین مقام حقوق بشر سازمان ملل متحد درمورد صدور حکم اعدام برای محمدعلی طاهری در ایران ابراز نگرانی شدید کرد.
دفتر حقوق بشر سازمان ملل متحد می‌گوید محمدعلی طاهری روز شنبه پس از آن که به اتهام «افساد فی‌الارض» گناهکار شناخته شد، با حکم اعدام مواجه شد.
زید رعد الحسین، کمیسر عالی حقوق بشر سازمان ملل متحد در بیانیه‌ای گفت صدور حکم اعدام برای طاهری نشانگر اعمال «مشکل‌آفرین» حکم اعدام برای جرائم کوچک و همچنین برای مجرمان صغیر است.
زید همچنین خطاب به مقامات ایرانی خواستار «رفع فوری اتهامات علیه طاهری و آزادی بی‌قیدوشرط او شد.»
دفتر کمیسر عالی حقوق بشر سازمان ملل متحد می‌گوید محمدعلی طاهری، بنیانگذار جنبش معنوی ایران است که در زمینه فرضیه طب جایگزین فعالیت می‌کند.
محمود علیزاده طباطبایی، وکیل مدافع محمدعلی طاهری، بنیانگذار شیوه معنوی «عرفان حلقه» در ایران پیشتر به خبرگزاری تسنیم گفت مطلع شده «شعبه ۲۸ دادگاه انقلاب حکم اعدام محمدعلی طاهری را صادر کرده اما این حکم هنوز ابلاغ نشده است.»
وکیل آقای طاهری گفت تمام فعالیتهای موکلش «با مجوز انجام شده بود.»
محمدعلی طاهری در سال ۱۳۸۹ توسط ماموران اطلاعات سپاه پاسداران و به اتهام اقدام علیه امنیت کشور دستگیر شد. او پس از ۶۷ روز بازجویی در زندان اوین به قید وثیقه آزاد شد. او اوایل سال ۱۳۹۰ مجددا به اتهام «ارتداد، محاربه، توهین به مقدسات، فساد فی الارض و سب النبی» دستگیر و زندانی شد.
دادگاه انقلاب پیشتر طاهری را به اتهام «توهین به مقدسات، مداخله غیرقانونی در امور پزشکی و درمان بیماران، ارتکاب فعل حرام و رابطه نامشروع، استفاده غیرمجاز از عناوین علمی (دکتر و مهندس)، ضاله بودن کتب و آثار» به پنج سال حبس، ۹۰۰ میلیون تومان جزای نقدی و ۷۴ ضربه شلاق محکوم کرده بود.
خبرگزاری فارس در اواخر سال ۱۳۹۳ گفت «سه تن از مراجع تقلید طی استفتائاتی که از سوی دستگاه قضا صورت گرفته است، حکم ارتداد طاهری را صادر کرده اند.»