وزیر اطلاعات جمهوری اسلامی اعلام کرد که «بر اساس گزارش و اطلاعیه سپاه» هیچ نقشی برای عوامل نفوذی در کشته شدن اسماعیل هنیه دیده نشده است.
اسماعیل خطیب در حالی به گزارش و اطلاعیه سپاه استناد کرده است که در زمان کشته شدن اسماعیل هنیه در تهران، او وزیر اطلاعات دولت ابراهیم رئیسی بود که در دولت پزشکیان هم در این سمت ابقا شد.
وزیر اطلاعات پیش‌تر و در واکنش به کشته شدن هنیه در تهران در پیامی گفته بود که «ترور اسماعیل هنیه با چراغ سبز آمریکا انجام شد.»
اسماعیل هنیه، رئیس پیشین دفتر سیاسی حماس، و محافظ شخصی او، وسیم ابوشعبان، در بامداد روز چهارشنبه ١۰ مرداد در یکی از مناطق امنیتی تهران کشته شدند.
بنا بر گزارش‌های منتشر شده، به طور کلی، سناریوهای مربوط به نحوه کشته‌شدن رهبر پیشین حماس و محافظ شخصی‌اش را، به رغم برخی تفاوت‌ها، در دو دسته «حمله به وسیله پرتابه» و یا «بمب‌گذاری در محل اقامت» آنها قابل دسته‌بندی است.
در حالی که جمهوری اسلامی و بطور مشخص سپاه پاسداران مدعی است اسرائیل با شلیک پرتابه به محل اقامت هنیه او را کشته است، رسانه‌های خارجی به نقل از مقام‌های اطلاعاتی و امنیتی غربی و برخی منابع ایرانی صحت سناریوی دوم را تایید می‌کنند.
نشریه آکسیوس نیز روز پنجشنبه ١١ مرداد در گزارشی مشابه با گزارش نیویورک‌تایمز به نقل از «دو منبع آگاه» نوشت هنیه با انفجار بمبی که پیش‌تر در اتاق محل اقامت او جاسازی‌شده بود، کشته شد.
آکسیوس در گزارش خود آورده است که عوامل موساد در داخل خاک ایران پس از حصول اطمینان از حضور هنیه در اتاق محل اقامتش بمب را از راه دور منفجر کرده‌اند.
شبکه خبری سی‌ان‌ان روز پنجشنبه ١١ مرداد به نقل از «یک منبع مطلع» گزارش داد که بمب عامل کشته‌شدن رهبر پیشین حماس از دو ماه پیش‌تر به طور مخفیانه در اتاق محل اقامت او جاسازی شده بود. سی‌ان‌ان نیز همانند آکسیوس گزارش داد که مقام‌های آمریکایی پس از کشته‌شدن هنیه توسط اسرائیلی‌ها در جریان عملیات قرار گرفتند.
در همین روز، جروزالم‌پست نیز در گزارشی به طور مستقل تایید کرد که اسماعیل هنیه بر اثر انفجار یک بمب جاسازی‌شده در اتاق محل اقامتش کشته شده است.
۱۴ مرداد ماه نیز ابوالفضل ظهره‌وند، عضو کمیسیون امنیت ملی مجلس ادعا کرده بود اسرائیلی‌ها در داخل تهران و ایران شبکه نفوذ دارند؛ زیرا ایران کشور بزرگی است و اسرائیلی‌ها عناصر شروری در ایران دارند که با آنها همکاری دارند و در شبکه موساد خودشان را تعریف کرده‌اند.