دفتر هیأت معاونت سازمان ملل متحد در افغانستان (یوناما) روز پنجشنبه ۲۶ مهر در پی انتشار گزارش‌هایی درباره شلیک نیرو‌های مرزبانی جمهوری اسلامی به اتباع افغانستان که قصد ورود غیرقانونی به ایران داشتند، این موضوع را نگران‌کننده توصیف کرد و خواستار تحقیقات شفاف در این زمینه شد.
«یوناما» همچنین خواستار حفظ حقوق مهاجران، پناهندگان و پناهجویان براساس قوانین بین‌المللی شد.
وب‌سایت حال‌وش که اخبار و تحولات جنوب شرقی ایران را دنبال می‌کند، روز چهارشنبه ۲۵ مهر گزارش داد که بیش از ۲۰۰ پناهجوی اهل افغانستان در منطقه مرزی کلگان در سراوان استان سیستان و بلوچستان به دست نیرو‌های مرزبانی جمهوری اسلامی کشته یا زخمی شدند.
صدای آمریکا به صورت مستقل نمی‌تواند این آمار را تأیید کند.
در پی انتشار این خبر، گزارشگران ویژه حقوق بشر سازمان ملل و همچنین سازمان عفو بین‌الملل خواستار تحقیقات شفاف و بی‌طرفانه در این زمینه شدند.
حکومت طالبان نیز گفته است هیأتی برای تحقیق در مورد گزارش های مربوط به تلفات تعدادی از شهروندان افغانستان در سرحد بین ایران و پاکستان تعیین کرده است که تحقیقات در این مورد را به زودی آغاز خواهد کرد.
سازمان عفو بین‌الملل گزارش‌ها درباره «تیرباران شدن» پناهجویان افغانستانی به دست نیرو‌های مرزبانی جمهوری اسلامی ایران را «وحشتناک» خواند و در بیانیه‌ای خواهان تحقیقات بی‌طرفانه و مبتنی بر عدالت درباره آن شد.
همچنین مای ساتو، گزارشگر ویژه حقوق بشر سازمان ملل در امور ایران، خواستار تحقیقات فوری برای شفاف‌سازی گزارش‌ها درباره کشته و مجروح شدن مهاجران پرشمار افغانستانی در منطقه مرزی کلگان سراوان در استان سیستان و بلوچستان ایران شده است.
علاوه بر این، ریچارد بنت، گزارشگر ویژه حقوق بشر سازمان ملل در امور افغانستان، نیز خواهان تحقیق درباره این گزارش‌ها شده و تأکید کرده که شهروندان افغانستان در سراسر جهان «به کرامت و امنیت بیشتری نیاز دارند.»
در مقابل، مقامات جمهوری اسلامی وقوع این رویداد را رد کرده‌اند و حسن کاظمی قمی، سفیر جمهوری اسلامی، در افغانستان گفته است: «در نتیجه پیگیری‌های مستقیم از طریق منابع معتبر تا این لحظه، مشخص گردید که اخبار در زمینه جان باختن ده‌ها اتباع غیرقانونی در مرز سراوان صحت ندارد.»