فیلم مستند سربازان رهبر داستان مداحان ستایشگر علی خامنه‌ای است. این مداحان نزدیک به هرم قدرت سیاسی، نوعی از برداشت مذهبی را ارائه می‌دهند که ادامه وجود پیامبر اسلام و ائمه شیعیان، تنها «ولی‌فقیه» است. با گذشت چند سال از شروع رهبری علی خامنه‌ای، فاصله او با گروهی از مداحان کمتر و کمتر شد و با حمایت‌هایی که از برخی آنان به عمل آمد؛ رفت و آمدهای برخی از مداحان به دفتر رهبر جمهوری اسلامی، بیشتر و پررنگ‌تر شد. شبکه مداحان حکومتی مواضع‌شان را کاملا با خامنه‌ای تطیبق می‌دهند و به همراه نیروهای خود در هیات‌ها در نقش پیاده نظام وسربازانی انقلابی و خط مقدم، در مقابل هرگونه اندیشه متفاوت با رهبر خود می‌ایستند و با آن مقابله می‌کنند. آنان بعد از سرکوب زبانی و کلامی برخی شخصیت‌های سیاسی و منتقد حاکمیت، در نقشی جدید با نیروهای امنیتی برای سرکوب مردم معترض همراه شدند و ...