آیت الله محمد یزدی، روحانی بانفوذ حکومت ایران، نسبت به گرایش بحث‌ها حوزه علمیه قم به سمت جدایی دین از سیاست، ابراز نگرانی کرد.
رئیس جامعه مدرسن حوزه علمیه قم در جمع نماندگان طلاب حوزه علمیه، چند نگرانی خود در مورد حوزه علمیه را برشمرد و گفت: «نگرانی اول من این است که در حوزه متاسفانه درس و بحث‌ها به سمت جدایی دین از سیاست حرکت می‌کند لذا نمایندگان طلاب باید آنان را تحت نظر و کنترل داشته باشند.»
جمهوری اسلامی، اصول و احکام دینی را مبنای نگرش سیاسی و تصمیمات خود قرار داده است و جدایی دین از سیاست را مغایر با اصول خود می‌داند.
او مسائل اخلاقی طلاب را هم یکی دیگر از نگرانی های خود عنوان کرد و گفت که طلاب و خانواده‌های آنها آموزش اخلاقی ببینند.
یزدی همچنین تربیت طلاب به منظور کادرسازی برای شورای نگهبان، قوه قضاییه و مسئولیت‌های کلان کشور را نیز یکی دیگر از نگرانی‌های خود اعلام کرد.