آیت الله خامنه ای رهبر جمهوری اسلامی ایران در سخنانی در روز شنبه پنجم تیرماه فشارهای اخیر از سوی دولت بحرین به یک روحانی شیعه را مورد انتقاد قرار داد. او "تعرض حاکمان بحرین" به شیخ عیسی قاسم را "نشانه بلاهت آنها" دانست.
رهبر جمهوری اسلامی ایران گفت: "شیخ عیسی قاسم فردی است که تا وقتی می‌توانست با مردم بحرین حرف بزند، آنها را از حرکات تند و مسلحانه منع می‌کرد اما حاکمان بحرین متوجه نیستند که تعرض به این عالم مجاهد، به معنای برداشتن مانع از مقابل جوانان حماسی و پرشور بحرین برای انجام هر اقدامی در مقابل حکومت است."
حکومت بحرین، در تازه ترین اقدام در فشار آوردن به مخالفان عمدتا شیعه این کشور، تابعیت شیخ عیسی قاسم، معروف ترین روحانی شیعه این کشور را سلب کرده است.
پیشتر قاسم سلیمانی فرمانده نیروی قدس سپاه پاسداران ایران از این اقدام انتقاد کرده و هشدار داده بود شیخ عیسی قاسم "خط قرمز"ی است که تجاوز به حریم آن نابودی آن کشور را به دنبال دارد و برخورد با او "راهی جز مقاومت مسلحانه را برای مردم باقی نمی گذارد."