محمد فرهادی، وزیر علوم ایران حکم روسای ۲۱ دانشگاه ایران را صادر کرد. این افراد پیش از این به عنوان سرپرست دانشگاه مشغول فعالیت بودند.
انتخاب محمود نیلی احمدآبادی به ریاست دانشگاه تهران که پیشتر گزینه حسن روحانی برای وزارت علوم بود خبرسازترین انتخاب وزیر علوم است.
آقای نیلی به اتهام حمایت ازاعتراضات پس ازانتخابات ۱۳۸۸با رای عدم اعتماد مجلس روبرو شد. انتخاب او به ریاست دانشگاه تهران با انتقاد اصولگرایان روبرو شده است.
محمد ملکی - فعال سیاسی و نخستین رئیس دانشگاه تهران پس از پیروزی انقلاب سال ۱۳۵۷ به بخش فارسی صدای آمریکا گفت به اینکه فضای امنیتی حاکم بر دانشگاههای ایران با انتخاب روسای جدید دانشگاه ها تغییر کند چندان خوشبین نیست.
در حالی که خبرگزاری مهر گزارش داده است که احکام جدید روسای دانشگاه ها پس از تایید شورایعالی انقلاب فرهنگی صادره شده است، خبرگزاری فارس، مخالف دولت حسن روحانی، صدور این احکام را غیرقانونی و از طریق تشکیل کمیته ای ویژه در شورایعالی انقلاب فرهنگی دانسته است.