افغانستان اين اتهام را که تروريست های مسئول حمله به يک مسجد در کويته با افغانستان ارتباط داشتند رد کرده است. وزارت امور خارجه افغانستان روز دوشنبه حمله را که در آن بيش از ۵۰ تن کشته شدند، ناشی از خشونت های فرقه ای در پاکستان دانست. يک سخنگو گفت اين حادثه هيچ ارتباطی به افغانستان نداشت و چنين اتهامی قابل توجيه نيست.
هفته پيش وزير امور خارجه پاکستان حمله به مسجد شيعيان را به تروريست هايی که در افغانستان ريشه دارند نسبت داد. افغانستان همچنين ادعای پاکستان را که هند ممکن است نقشی در حمله ايفا کرده باشد نيز بی اساس دانست.