محمد خاتمی رئيس جمهوری سابق ايران اسامه بن لادن را بعنوان جنايتکاری که خيانت به پيام صلح و عدالت اسلام نموده، تقبيح کرد.
اشاره شديداً انتقادی آقای خاتمی به رهبر شبکه تروريستی القاعده در سخنرانی خود در دانشگاه هاروارد آمريکا، با کف زدن حضار استقبال شد.
از سوی ديگر رئيس جمهوری سابق ايران گروه ستيزه گر حزب الله را بمثابه نماد مقاومت اعراب در برابر اسرائيل، ستود.
با کشيدن خط فاصل بين مقاومت و تروريسم آنچه را که آقای خاتمی "اعمال بربريت" پيروان اسامه بن لادن در آمريکا در پنج سال پيش ناميد، محکوم کرد.
با اينکه عموماً عقيده بر آنست که ايران يکی از عمده ترين حاميان عمليات نظامی حزب الله است، رئيس جمهوری سابق ايران گفت کشور متبوع وی هيچ کمک مالی برای عمليات نظامی ستيزه گران تأمين نميکند.
معترضين به حضور آقای خاتمی در محل سخنرانی هاروارد که در نزديکی شهر بوستون آمريکا که آخرين توقف تور پنج روزه اين روحانی ايرانی از آمريکا بود، تجمع کرده بودند. آنها آقای خاتمی را متهم ميکردند که مسؤل نقض مکرر حقوق بشر در ايران در دوران رياست جمهوری خود بين سالهای ١٩٩٧ و ٢٠٠٥، بوده است.